Καθαρίζετε το παγούρι μετά από κάθε χρήση. Αν καταναλώνετε ισοτονικά ποτά, ξεπλύντε σχολαστικά όλα τα μέρη του παγουριού, όπως τη φιάλη, το καπάκι και το πώμα για να απομακρυνθούν τυχόν υπολείμματα. Χρησιμοποιήστε υγρό πιάτων και μακριά βούρτσα για να καθαρίσετε καλά τον πάτο της φιάλης. Αφήστε να στεγνώσει καλά και αποθηκεύστε χωρίς το καπάκι, ώστε η φιάλη να αερίζεται. Διαφορετικά, μπορεί να σχηματιστεί μούχλα στο εσωτερικό.
Δεν πλένεται στο πλυντήριο πιάτων (ιδίως σε θερμοκρασίες > 70°C).